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乔园园

乔园园

  • 学历:博士

  • 毕业院校:南开大学

  • 职称:副研究员

  • 管理职务:

  • 学科专业:应用化学

  • 系所单位:中心实验室

  • 特殊人才称号:

  • 通讯地址:南开大学中心实验室

  • 电话:23501380

  • 电子邮件:yuanyuanqiao AT nankai ⋅ edu ⋅ cn



课题组网站Research Group‘s Website
研究领域Research Field

化学软件、化学数据库的开发

小分子药物的设计、合成与优化

图谱与图像信息识别,数据挖掘

 



教育与科研经历Education and Scientific Research Experience

主讲课程:

1)本科生课程

(1)计算机化学基础(全英语)本科D类

(2)化学软件开发 本科D类

(3)理论与计算化学的基础与前沿,本科夏季学期

2)研究生课程

(1)计算机化学,应用化学硕士

(2)化学工程专业英语,化学工程专业硕士



荣誉和奖励Honor and Awards


1997年,国家级教学成果二等奖(集体,第三人)(国家“九五”攻关项目《多媒体计算机辅助有机化学教学》)
1997年,天津市教学成果一等奖(集体,第三人)
1997年,南开大学教学成果一等奖(集体,第三人)

1999年,中国分析测试协会(CAIA)一等奖(《国际粉末衍射标准数据的研制》主要参加者)

1999年,南开大学优秀教师二等奖

2009年,国家级教学成果一等奖(《南开大学近代化学教学丛书(1999-2008)(教材)》,集体,第三人)。
2009年,天津市教学成果一等奖(集体,第三人)
2009年,南开大学教学成果一等奖(集体,第三人)



乔园园。化学信息系统开发技术。化学工业出版社。2011年。 2012 年获中国石油和化学工业联合会石油和化学工业出版物奖(图书奖)二等奖。



科研成果Achievements in Scientific Research

长期从事软件开发与数据处理研究,具备丰富的开发经验,承担多项纵向和横向科研项目。  

 

  • 在科技部“十五”攻关项目《科学仪器通用软件平台研究与开发》中,开发了大量功能模块,包括谱图数据平滑去噪(如邻接点平均平滑、二项式平滑、傅立叶平滑)、谱图数据滤波(如傅立叶带阻滤波、傅立叶带通滤波、傅立叶低通滤波)和谱图峰分析(如寻峰、峰标记、求面积)等,为实现科学仪器的国产化做出了重大贡献。

  • 2004年,药物发现与化学数据库知识发掘(天津科委)

  • 天津市科委面上项目《美索巴莫盐的晶习预测与多晶型研究》(2011-2014)课题负责人。

  • 合作承担的天津市科委重点项目《重大疾病中医客观化疗效评价理论与方法》(2010-2013)中,负责软件开发和数据发掘方面的研究。

  • 合作承担自然科学基金项目《基于多层次证据融合理论确立《伤寒杂病论》方治疗慢性病循证决策研究》(2014-2017)项目批准号:81373891,负责算法设计及软件开发。

 

部分横向合作项目:

 

  • 2006年,MMP酶小分子抑制剂的设计

  • 2007年,MMP酶活性中心构象分析及药物设计

  • 2007年,FabF酶活性中心构象分析及药物设计

  • 2008年,Cox2酶活性中心构象分析及药物设计

  • 2008年,新型Lipitor多晶型物的制备、分析及结晶规律研究

  • 2008年,基因表达调控网络分析系统的建立

  • 2009年,ABI激酶活性中心构象分析及药物设计



代表论文Representative Publication

l  Sha Zhou, Tao Yan, Yuxin Li; Zhehui Jia; Baolei Wang; Yu Zhao, Yuanyuan Qiao, Lixia Xiong, Yongqiang, Li, Zhengming Li*, Novel phthalamides containing sulfilimi nyl moieties and derivatives as potential ryanodine receptor modulators. Organic and Biomolecular Chemistry, 2014, 12(34):6643-6652

l  Hui-Jing Li, Yan-Chao Wu*, Jian-Hong Dai, Yan Song*, Runjiao Cheng andYuanyuan Qiao, Regioselective Electrophilic Aromatic Bromination: Theoretical Analysis and Experimental Verification. Molecules, 2014, 19(3):3401-3416

l  Hongbo Zhang, Xin Ning, Hang Hang, Xuyan Ru, Haichen Li, Yonghong Li, Lizhong Wang, Xiao Zhang, Shujing Yu,Yuanyuan Qiao, Xin Wang*, and Peng George Wang*, Total Synthesis of Thaxtomin A and Its Stereoisomers and Findings of Their Biological Activities, Organic Letters, 2013, 15(22):5670-5673

l  Hichen Li and Yuanyuan Qiao*, Bimolecular nature of boron trifluoride catalyzed glycosylation of a galactosyl donor: the role of the acceptor. International Journal of Quantum Chemistry, 2013, 113(16):1975-1980

l  Xia Wu*, Genhua Wu, Youcun Chen, and Yuanyuan Qiao*, Structural Optimization of Cu-Ag-Au Trimetallic Clusters by Adaptive Immune Optimization Algorithm. The Journal of Physical Chemistry, A., 2011, 115(46):13316-13323

l  Tao Lu, Yuanyuan Qiao*, Panwen Shen., Molecular path for ligand search. Chinese Chemical Letters, 2011. 22:1130-1134

l  刘艳莉; 孙雨耕*; 程鹏*; 孙宏伟; 孟庆浩; 乔园园, 数字化教学资源共享信息平台建设研究, 现代远距离教育, 2011. 137(2):39-42

l  鹿涛, 乔园园*, 申泮文, 车云霞, 分子路径及其在药物发现中的应用, 南开大学学报(自然科学版), 2010. 43(1):102-106

l  章宇奇, 乔园园*, 南开BT站--校园信息分享的可靠模式, 信息系统工程, 2010. 8:67-68

l  陆小左*, 阚湘苓, 胡广芹, 乔园园, 中医"三不"病机研究, 天津中医药, 2010. 27(2):125-126

l  鹿涛, 乔园园*, 申泮文, 车云霞, NKChemSQL--针对MySQL的化学信息学扩展, 计算机与应用化学, 2009. 26(10):1358-1362

l  乔园园*, 宋端磊, 孙可, 基于数据库信息的取代基选择, 计算机与应用化学, 2008. 25(8):1027-1030

l  乔园园*, 杨玲, 吴夏,张明涛, 舌色的模式识别研究, 计算机与应用化学, 2008. 25(6):721-723

l  乔园园*, 鹿涛, 车云霞, 化学信息学与生物信息学之开放性比较, 化学进展, 2007. 19(4):624-632

l  李飞, 乔园园*, 车云霞, 动态显示生物大分子的JDM插件, 计算机与应用化学, 2007. 24(10):1401-1403

l  乔园园*, 张明浩, 刘冲, 虚拟组合衍生程序系统的研制, 计算机与应用化学, 2007. 24(2):193-195

l  庞美丽, 乔园园*, 刘冲, 车云霞, 交互式三维分子模型播放器的开发与应用, 宁夏大学学报(自然科学版), 2007. 28(5):335-337

l  乔园园*, 郭盛, 分子模拟软件MOE及其在药物发现中的应用示例, 计算机与应用化学, 2005. 22(2):157-160

l  乔园园*, 刘建涛, 刘冲, 化学信息学与药物发现研究的开放性, 计算机与应用化学, 2006. 23(8):795-800

l  乔园园*, 孙可, 刘冲, 化学信息学与开源软件, 计算机与应用化学, 2006. 23(12):1283-1286

l  乔园园*, 吴夏, 杨玲, 张明涛, 化学信息学开源软件的集成与复用, 计算机与应用化学, 2006. 24(1):133-136

l  Yuanyuan Qiao and Shaofan Lin*, Data Mining by Nonlinear QSAR Models for Drug Discovery

l  南开大学学报(自然科学版), 2004. 37(2):59-69

l  Yuanyuan Qiao*, Yunfei Xi, Dongtao Zhuo, Jijun Wang and Shaofan Lin, Qualitative phase analysis system for crystalline mixtures based on X-ray Powder Diffraction File. Powder Diffraction, 2004. 19(4):340-346

l  乔园园*, 林少凡, 虚拟组合分子库的设计与实现, 计算机与应用化学, 2004. 21(5):721-724

l  Mingtao Zhang, Yuanyuan Qiao*, Shaofan Lin, and Xinkan Yao*, X-ray powder diffraction analysis of three two-component molecular crystals: 4-chloroanilinium and chloronitrobenzoic acids, Powder Diffraction, 2004. 19(3):296-301

l  Mingtao Zhang, Yuanyuan Qiao, Shaofan Lin, and Xinkan Yao*, X-ray powder diffraction analysis of three 4-tert-butylcalix(4) arenas, Powder Diffraction, 2004. 19(2):181-185

l  Pulan Yu, Shuang Ding, Yuanyuan Qiao, Xinkan Yao, Chong Liu, and Shaofan Lin*, X-ray diffraction data of C16H14O4Ru2M (M=Si, Ge), Powder Diffraction, 2002. 17(1):44-47

l  Pulan Yu, Shuang Ding, Yuanyuan Qiao, Xinkan Yao, Haiyue Zhang, and Shaofan Lin*, Powder diffraction analyses of substituted sulfonylurea, Powder Diffraction, 2002. 17(1):48-51

l  Pulan Yu, Shuang Ding, Yuanyuan Qiao, Xinkan Yao, Haiyue Zhang, and Shaofan Lin*, X-ray powder diffraction studies of multipyrazole series compounds, Powder Diffraction, 2001. 16(4):231-235

 



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